On sait peu de choses de l’histoire ancienne du Burkina Faso qui a connu un peuplement très précoce, soit vers 12 000 à 5 000 ans avant l’ère chrétienne du moins pour ce qui est de la partie Nord-Ouest du Pays. En effet, des fouilles archéologiques ont permis la découverte d’outils dans les années 1970. La sédentarisation serait apparut entre 3 600 et 2 600 avant l’ère chrétienne avec des agriculteurs, dont les traces des constructions ont été retrouvées. L’emploi du fer, de la céramique et de la pierre polie se développe entre 1 500 et 1 000 avant l’ère chrétienne, ainsi que l’apparition de préoccupations spirituelles, comme en témoignent les restes d’inhumation découverts.

Des vestiges attribués aux Dogons sont découverts dans la région du centre-nord, du nord et du nord-ouest. Or ceux-ci ont quitté le secteur entre le XVe et le XVIe siècle pour s’installer dans la Falaise de Bandiagara au Mali. Par ailleurs, des restes de constructions sont découvertes dans le sud-ouest du Burkina Faso (ainsi que dans le pays voisin la Côte d’Ivoire), mais ont ignore leurs origines avec certitude.

Suite à l’apparition de l’agriculture, une vague de cavaliers vint alors greffer une aristocratie militaire sur cette structure. Détenteurs du pouvoir politique, ces cavaliers passèrent des accords avec les autochtones qui restent propriétaires du sol. Cette organisation apparaît encore de nos jours sous forme de chefs de cantons et chefs de la terre ou Chefs traditionnels. Les premiers royaumes mossis se sont alors constitués: le Gourma, le Mamprousi, le Dagomba, leYatenga et le royaume de Ouagadougou. Ce dernier devint rapidement le plus influent. Il était dirigé par le mogho naba, à la fois roi et magicien. Aux XIIIe et au XIVe siècles, ces royaumes s’opposèrent aux grands empires de la boucle du Niger dont qu’ils n’hésitaient pas à attaquer les frontière et à s’avancé dans leur territoire. La puissance de leurs armées permit aux mossis de préserver l’essentiel de leur indépendance. Mais, à la fin du Xve siècle, l’Empire songhay établit sa suprématie sur la boucle du Niger, mettant fin aux avancées des cavaliers Mossis.